Peter Letzner arbeitete viele Jahre als Nachwuchstrainer bei Wacker Innsbruck. Anfang 1984 übernahm er zusätzlich auch das Traineramt bei den Wacker-Damen, unterstützt von Co-Trainer Herbert Hallegger.
1986 wurde er Trainer der Kampfmannschaft Wackers welche nach der Gründung des FC Swarovski Tirol in der 2. Klasse neu zusammengestellt wurde. Eine logische Entscheidung, da der Großteil des Kaders aus der vorjährigen Juniorenmannschaft stammte.
Nach zwei Meistertitel in Folge (2.Klasse Mitte, 1.Klasse Ost) übernahm die Kampfmannschaft Werner Schwarz. Peter Letzner arbeitet wieder im Nachwuchs der Schwarz-Grünen, die Damenmannschaft löste sich in dieser Zeit auf.
Im Sommer 1990 musste sich Peter Letzner infolge schwerer Erkrankung von seiner Trainertätigkeit zurückziehen.